由於小花枝的年纪尚小，对於有些剧情还是无法理解，她总是边看便问哥哥她看不懂的部分，而陈以铭也总是耐心地回答妹妹的提问，从没表现出任何不耐。小花枝的好奇心与想像力总是天马行空，陈以铭觉得妹妹这样很可Ai。
《判官孙行者》主要的故事是在讲天才科学家唐博士与他创造的三名生化超人打击妖怪的故事。
唐博士的父母在他小时候被被妖怪杀Si，从此唐博士便发愤图强，努力读书变成世界上最厉害的科学家，并且利用妖怪细胞跟人类细胞融合制造出生化超人来为父母报仇。
因为这部卡通的设定人类是杀不Si妖怪的，而妖怪则都是做了坏事，被一种名为「业力」的能量影响的人类变成的。
三名生化超人分别是大哥孙行者、二弟朱不戒与三弟沙不Si。
孙行者也是三名生化超人中最强，最聪明的，因为只有他是唐博士用自己的细胞创造的。但也是最调皮最Ai恶作剧的成员。孙行者的法宝武器是可以变大变小，一挥就可以把b大楼还高的红牛魔王打飞到月亮上，由超奈米合金做的金刚bAng。
这次故事的舞台主要是在一个名为「美丽」的岛上，岛上的人民很善良，与世无争，也安居乐业。
但有一天，来了两个妖怪，分别为蓝角怪魔与白眼狼JiNg。牠们是红牛魔王的手下败将，原本是计画合力抢夺红牛魔王的妖怪王宝座，却还是输给了红牛魔王，只好逃到美丽岛，并抢占地为王，狼狈为J，自封为蓝角大王跟白眼狼王。
这个岛被这两个妖怪支配，被Ga0得乌烟瘴气，岛民全部被当成奴隶，甚至是食物，不听话的就会被变成绿sE青蛙。
那画面非常可怕。小花枝看到那些岛民变成青蛙被踩Si或被妖怪吃掉时，忍不住紧紧抓着哥哥的手。
而故事的发展就是跟平常的一样，两个妖怪想夺取金刚bAng，因为其为唯一能制衡红牛魔王的武器。於是幻化成美nV去诱惑唐博士并且将之绑架，唐博士最喜欢美nV了，虽然孙行者一眼就看穿妖怪的计谋，但唐博士也跟平常一样不听劝，就被抓到美丽岛的妖怪巢x了。
孙行者、朱不戒与沙不Si无奈之下追到了美丽岛，而角大王跟白眼狼王很清楚生化超人三兄弟只能杀妖怪不能杀人，於是控制所有的岛民去压制他们。
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